可否认是重要因素之一。从种种迹象看，这次蒙古军中的疫病并不仅仅是一种，纽璘军队冬天疫病肆虐，估计不太可能是疟疾，而史天泽军队中的疫病因是在夏天流传，猜测是疟疾和肠道传染病的可能性最大。

元世祖忽必烈至元十四年（1277年），交趾王陈光昺卒，子陈日烜继位，遣使向元朝通报继位的消息。但陈日烜有一点做得没有让元朝人满意，因为交趾是大元的属国，其国王继位需经元朝的册立，而陈日烜没有上报元朝中央就自立，引起了元**的大为不满。次年，元朝遣礼部尚书柴椿等持诏让日烜到元大都受命。柴椿说：“汝父受命为王，汝不请命而自立，现在又不入朝，将来朝廷加罪，你将怎么来逃脱罪责？”元朝使者还不参加日烜为他们举办的欢迎宴会。交趾和元的关系日益紧张。

柴椿等回到京师，枢密院听了汇报后认为应该进兵，遣官问罪，但忽必烈没有同意。因为其时朝廷打算讨伐占城，希望交趾能支援兵粮，再说日烜弟陈璨已经上书中央，自愿纳款归降。

至元二十年（1285年），忽必祖派其子镇南王征讨占城，元荆湖占城行省通知陈日烜要运粮支援元军，当镇南王路过交趾时就出来迎接。但日烜说其国至占城水陆交通不便，至于军粮，只能根据自己的力量行事。

镇南王派出的征伐占城大军到达禄州，陈日烜以为元军是去进攻交趾的，调兵拒守。镇南王派人前去讲清大军是为了占城而发，但陈日烜十分担心，决定冒险邀击元军。几次接触后，交趾军队失败，元军攻至安南城下。不久陈日烜被迫传位于皇太子，自己逃向海边港口。镇南王命中书左丞、行省荆湖李恒率兵追袭，取得一些小仗的胜利。

由于其时安南天气炎热，已进入雨季，暴雨几乎每天要下一场，困乏的元军中开始出现疫病，死伤惨重。由于这次元军准备并不充分，长期征战在外，减员严重，蒙古马不能发挥出应有的作用，被迫退兵思明州，途中还遭到交趾兵的偷袭，占城行省右丞唆都及长期居留疟疾地区，身体得病的李恒等都中箭毒发身亡。

这次陈日烜和元军的交战，使忽必烈大为……